Schemat organizacyjny
Komenda Główna Straży Ochrony Kolei jest zakładem pracy usytuowanym w strukturach PKP Polskie Linie Kolejowe S.A. Jest ona nadrzędną jednostką organizacyjną w skład, której wchodzi 16 Komend Regionalnych Straży Ochrony Kolei.
Komendom Regionalnym podlega 78 Posterunków Straży Ochrony Kolei, które zlokalizowane są na terenie całego kraju.
W strukturze organizacyjnej Komendy Głównej Straży Ochrony Kolei znajduje się, jedyny funkcjonujący od roku 1945 do dziś, Ośrodek Szkolenia Zawodowego Straży Ochrony Kolei oraz Hodowli i Tresury Psów Służbowych w Zbąszyniu z filią w Przemyślu.